Pacbio三代测序平台在测序工作中关于可变剪切的问题如何解决呢？？

霸气御姐←_← 2021-06-12 04:46

如果把拼接工作看作是在做拼图游戏。NGS获得的读长都很短，就好象把一幅图打成非常小的碎片，然后做拼图。由于碎片太小，因此许多碎片看起来都差不多，这样要拼出一副完整的图难度很大。PacBio RS目前可以获得1300bp的平均读长，明年初随着试剂升级，平均读长可提升至2500-3000bp，这就相当于同样的一幅图，用大的碎片来做拼图，由于大碎片比小碎片的识别度要高，因此完成拼图的难度就可以大幅降低。
同NGS通常100-150bp的读长相比，PacBio RS的平均读长提高了近20倍。试想一下，同样大小的一幅拼图，10,000片的还是500片的更好拼？
另外，随着读长的增加，拼接过程中所需要测序覆盖深度也会随之下降。生物通 www.ebiotrade.com
对变异检测来说，我们首先需要的是准确定位，如果无法准确定位，那无论原始或者一致性准确度有多高都是没有意义的。而长读长可以帮助研究者进行更准开发者_如何转开发确的定位。

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